Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF18Q9UNG2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms