Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCML1Q9UN30 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms