Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms