Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms