Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL1Q9UK58 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms