Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms