Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACL1Q9UJ83 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACL1Q9UJ83 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms