Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms