Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms