Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD5Q9P267 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD5Q9P267 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms