Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms