Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms