Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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