Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBRD1Q9NUN5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms