Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms