Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms