Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms