Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAR1AQ9NR31 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAR1AQ9NR31 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms