Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms