Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC2Q9C0B9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC2Q9C0B9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms