Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms