Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-6Q9BXR3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms