Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms