Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM2Q9BVW6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms