Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms