Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT8L2Q96SF2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms