Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms