Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms