Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms