Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms