Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC11Q96J66 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms