Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms