Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC97Q96F63 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms