Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms