Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms