Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms