Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms