Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RAB11FIP4Q86YS3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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RAB11FIP4Q86YS3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP4Q86YS3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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