Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms