Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms