Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms