Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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