Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFCAB12Q6NXP0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms