Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms