Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GDF6Q6KF10 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms