Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SUCLG2P4-201ENST00000514739 1027 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C4orf48Q5BLP8 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms