Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC38Q502W7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms