Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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