Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms