Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RRN3P1Q2M238 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms